Az APT 0.6 verziójában jelent meg a crypto rendszer, amely figyeli a telepítendő csomag integritását. Ezáltal megtudhatjuk, hogy az éppen telepíteni kívánt csomag eredeti, vagy belepisztáltak-e a "csúnya bácsik". Amíg az aláírás nincs importálva, addig ilyen figyelmeztetéseket kapunk. Példa a http://ftp.hu.debian.org forráshelyre:
Az alábbi paranccsal lekérdezhetjük, hogy a A NO_PUBKEY után lévő számsorozat (a ${KEY} helyére írva) valós-e:
Ha úgy döntöttünk, hogy megbízunk a kulcsban, akkor pedig célszerű importálni, amit így tehetünk meg:
a http://ftp.hu.debian.org példa megoldása:
Ha a kulcs elérhető közvetlenül a szerverről is, és nem akarjuk ellenőrizni, akkor az alábbi megoldást is használhatjuk: